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李雪 | 给细胞表面画一张“高清地图”——第48期CACA前沿播观后感
2026-04-08 16:55

  国家消化系统疾病临床医学研究中心 李雪

  看完CACA前沿播第48期,谭蔚泓院士和方晓红、吴芩团队发表在Science上的这项研究,最大的感受是:他们给细胞表面膜蛋白研究,提供了一套“卫星导航系统”。

  膜蛋白有多重要?它是细胞生命活动的关键枢纽,是肿瘤的信号开关,是精准诊疗的核心靶点。HER2、EGFR这些明星靶点,都是膜蛋白。基于膜蛋白的分型分治,已经是经过实践检验能显著改善患者预后的路径。

  但问题在于:我们知道的膜蛋白,只是冰山一角。 大部分膜蛋白的功能、表达、相互作用,还是“黑箱”。传统的发现方法要么依赖抗体(周期长、成本高、通量低),要么依赖质谱(丢失空间信息、无法原位检测)。更关键的是,找到一个新膜蛋白,还要再花大量时间去开发对应的探针(抗体或配体),才能用于后续的诊断或治疗。这个“发现-验证-应用”链条,每一步都是瓶颈。

  这项研究的核心突破在于:它把“发现”和“探针获取”同步完成了。他们建立了一个叫“适体组学”的新平台。核酸适体是一段单链DNA或RNA,能像抗体一样特异结合靶标,但优势是可以通过体外筛选获得,且可测序、可扩增、可人工合成。团队将核酸适体文库与单细胞CRISPR扰动技术结合,开发了SPARK-seq技术——用基因编辑构建只有一个蛋白差异的多个细胞群,然后让适体文库去结合这些细胞,通过高通量测序读取适体序列,再用SPARTA算法解析适体与靶蛋白的一一对应关系。

  以前要找某个膜蛋白,得先知道它长什么样,再专门设计一个探针去抓它。现在是把一堆探针(适体文库)扔到细胞上,看哪个探针结合了哪个蛋白,然后通过基因扰动实验反向验证,一次性把“谁结合谁”的关系全部理清,这项技术的意义是多层面的。

  第一,它让膜蛋白研究从“预设目标”走向“无偏发现”。过去我们只能研究已知的、有抗体的靶点。现在可以系统地、高通量地去发现全新的膜蛋白功能靶点,绘制出一张“膜蛋白功能靶点地图”。

  第二,它打通了从发现到应用的“最后一公里”。发现的每一个新靶点,同时就获得了一个对应的核酸适体探针。这个探针可以直接用于流式细胞术、成像、靶向药物递送。

  第三,它为精准医学提供了“表型”维度。现在的液体活检主要检测ctDNA(基因型),但基因型不等于表型。适体组学可以同时读取血液中蛋白质、外泌体等表型信息,实现“多维超灵敏液体活检”。这对于肿瘤的早期筛查、疗效监测、复发预警,可能有革命性的影响。

  有时候,真正的突破不在于攻克一个具体靶点,而在于创造一套能系统性地发现靶点的工具。适体组学就是这样一套工具——它让膜蛋白研究从“盲人摸象”变成了“全景扫描”。期待这套技术早日走向临床,让更多患者受益。

 

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