包头医学院第二附属医院于1951年建院，是包头医学院直属附院，包头市青山区唯一一所自治区三甲综合医院。医院占地面积4.16万平方米，建筑面积9.5万平方米，开放床位800张，开设临床医技科室46个。拥有国家临床重点专科能力建设项目1个（消化内科）、国家中西医结合协同“旗舰”科室建设专科1个（针灸推拿科），自治区医疗卫生领先学科2个（消化内科、急诊医学科）、重点学科1个（针灸推拿科）、蒙医中医特色优势重点专科1个、高等教育重点学科1个（心血管内科）、研究所3个（内蒙古消化病研究所、内蒙古高血压研究所、内蒙古中蒙医药研究院针灸研究所）、质控中心1个（消化内科），工程中心1个（消化疾病防治内蒙古自治区工程中心）、重点实验室1个（疾病相关生物标志物实验室），包头市医疗卫生领先、重点、培育学科15个、临床重点建设专科3个（消化系统疾病肝病方向、结直肠肿瘤专业、急诊医学科）、质控中心6个（超声诊断专业、消化内科专业、急诊医学专业、医院感染管理、中医针灸、中医小儿推拿）、专科区域医疗中心1个（消化系统疾病）。

　　医院通过国家药物临床试验机构（GCP）认证；获批国家CAAE一级癫痫中心、内蒙古首家静脉用药调配与评价项目培训基地、自治区VTE防治副理事长单位，针灸推拿科获批中央财政资金中西医结合旗舰科室建设，挂牌自治区中蒙医研究院针灸研究所，皮肤科通过国家皮肤与免疫疾病临床医学研究中心银屑病诊疗中心验收并加入大疱性皮肤病暨重症皮肤病专科联盟，心内科通过国家标准化心脏康复中心认证成为全国第八批认证单位、荣获国家标准化房颤中心建设单位，消化微创外科获批包头医学院消化病微创外科研究所。高质量高水平发展外系科室，与北京宣武医院合作成立胸外科包头诊疗中心，与北京朝阳医院疝外科开展诊疗合作打造疝中心，引进包头市知名乳腺外科专家打造乳腺外科。挂牌包医二附院医疗集团二〇二院区并正式运行。开通互联网医院、上线“互联网+护理”服务。

　　医院现有职工1132人，其中高级职称321人，二级主任医师7人、三级主任医师6人；博士58人（含在读28人）、硕士238 人。拥有国务院特殊津贴专家、白求恩式好医生、人民名医·卓越建树等国家级人才称号7人，内蒙古自治区杰出人才、突出贡献专家、自治区名医等荣誉称号89人。

　　近年来，医院科研立项285项，包括国自然1项，内自然重大项目1项；发表SCI、中文核心等论文672篇；专利、论著、奖项109项。2020-2022年在国家公立医院绩效考核中连续三次获得B+的成绩。