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肿瘤标志物挖掘技术与应用必备技能培训会议圆满完成
2021-11-10 09:04  稿源:肿瘤标志专业委员会

  收获满满的生信培训圆满结束啦

  为了充分利用生物信息学资源和工具助力肿瘤生物标志物挖掘领域的研究,更好地研究肿瘤发生发展的分子机制、鉴定诊断及预后相关分子标记物、发现新的药物靶点,加快和促进肿瘤标志物的临床转化。

  作为2021年中国肿瘤标志物学术大会亮点活动之一,为配合疫情防控工作,中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会于2021年10月23-24日举办了第八届生信分析必备技能培训(线上),本次培训注重基础、强化实践、学以致用、促进合作。

  本次培训邀请哈尔滨工业大学、华中科技大学、河南大学、南京航空航天大学、温州医科大学、哈尔滨医科大学的知名专家及一线科研人员精心设计了课程体系,讲述了基因表达调控和癌症组学数据库,肿瘤标志物挖掘的生物信息工具应用,常见生物信息分析工具,R语言基础与绘图,肿瘤大数据分析,肿瘤免疫与生物信息概述及相关数据资源,肿瘤免疫微环境特征及案例分析。

  从数据获取入手,深入浅出地介绍数据挖掘和分析的具体方法,旨在让非生物信息学专业的科研人士,入门生物信息学专业的编程软件,轻松快速掌握网络资源分析利用的技能.

  课程内容

  10.23日上午由哈尔滨工业大学的黄艳、周殿双、顾悦博士讲授了基因注释和转录调控分析数据库NCBI gene、AnimalTFDB3.0、hTFtarget、FFLtool、JSAPAR、miRTarbase,和肿瘤组学分析数据库COSMIC、HMDD、IncRNAdisease、Inc2cancer、 IncACTDB、 m6ADD、DiseaseMeth、SEA的理论和使用方法;

  10.23日下午由河南大学的郭向前教授团队讲授了常见肿瘤标志物的筛选工具ONCOMINE以及TCGA表达数据分析工具GEPIA和GEO差异分析工具GEO2R的理论和操作方法;

  10.24日上午由哈尔滨工业大学的周殿双博士讲授了R语言基础命令及绘图软件包的使用以及癌症基因表达谱的差异分析流程及结果可视化及基于表观遗传修饰的癌症亚型分类与临床特征分析;

  10.24日下午由哈尔滨医科大学的韩俊伟教授团队讲授了生物信息在肿瘤免疫中的研究现状与发展趋势及数据库Immport、SIDB 、ImmuneSigDB介绍,以及免疫细胞浸润丰度计算及其与预后关系及基于免疫基因集合的预后标志识别。

  本次培训注重实际操作,熟练掌握利用生物信息学工具从肿瘤测序数据中挖掘肿瘤标志物的方法。

 

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