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第六届中国肿瘤学术大会一等奖论文摘要—外周血测定基因表达差异区分钼靶BI-RADS 0级病人中乳腺癌与良性乳腺疾病
2010-06-25 03:48  稿源:

  杨犇龙1*,徐清华2,叶迅2,柳光宇1,邵志敏1,孟夏2,B. Mougin2,吴炅1

  1.复旦大学附属肿瘤医院,复旦大学上海医学院肿瘤学系,上海200032

  2.梅里埃实验室(上海),上海200032

  【摘要】背景:由于亚洲女性,尤其是年轻女性乳腺的密度较高,体积较小,在大规模的钼靶筛查中常常诊断失败。放射诊断专家将这群人诊断为BI-RADS 0级,这通常意味着她们的乳腺有临床症状,但在影像学上无法判断其良恶性。在复旦大学附属肿瘤医院乳腺癌筛查中,BI-RADS 0级的概率约为10%。这部分病人通常被建议其他影像学检查(B超,MRI)的长期随访甚至手术活检,对病人来说,这是一个长期、昂贵、而且焦虑的过程。在本研究中,我们通过基因芯片技术测定这部分人群的外周血样本,分析乳腺癌和乳腺良性疾病的基因表达差异,希望找到一种外周血中的生物学标记物对病人进行早期诊断。

  方法:94个乳腺良性疾病和84个乳腺癌患者参与了本项研究。根据他们的钼靶分级,我们将这178个病人分成BI-RADS 0组(26名,5名乳腺癌患者)及BI-RADS非0组(152名,79名乳腺癌患者)。我们应用专用的PAXgene采血管取样,从外周血中分离出RNA(约5ug/例)。将外周全血RNA样本存于-80℃冰箱保存备用,用OD260/280和RIN(RNA Integrtion Value)来控制抽取后的RNA质量。其中,0.05ug用于基因芯片筛查。我们采用SAM(Significant Analysis of Microarray)方法筛选表达差异基因,对筛选得到的符合统计学意义的表达差异基因被用来构造SVM(支持向量机)分类模型。我们利用BI-RADS非0组的样本构建了一个28个基因(表1)的模型,并将其应用到BI-RADS 0组进行验证。(图1,2)

  结果:利用这个26个基因的模型,我们在BI-RADS非0组的病例中准确区分了88%的乳腺癌和乳腺良性疾病患者,并在BI-RADS 0组(一个独立的测试集)中达到73%的预测准确率。这28个基因在乳腺癌患者中大部分表达水平较良性患者更低。这些基因参与了细胞增殖,免疫,各调节蛋白的各个环节,而我们也注意到,其中一些防御免疫相关的基因则在乳腺癌患者中的表达水平较高。

  结论:利用芯片技术在外周血中测定基因学表达差异能够帮助我们区分乳腺癌和乳腺良性疾病患者,特别在钼靶无法区分良恶性的基础上。这需要更大样本的临床实验的验证。

  【关键词】乳腺癌;基因芯片;外周血,BI-RADS 0

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